analyticsのクロスドメイン設定をした際のカスタムフィルタ設定 https://support.google.com/analytics/answer/1034342?hl=ja&utm_id=ad にも書かれているが、上記処理をすべて完了させ、カスタムフィルタ設定を必ずおこなうこと。また、別途 共通のカート以外に、目標設定が成されている場合は、それらも www.から始まるドメインを記述して、ドメイン毎の目標を区分して入力しておくこと。